# HIV between+F scoring matrix
   A  R  N  D  C  Q  E  G  H  I  L  K  M  F  P  S  T  W  Y  V  B  Z  X  *
A  6 -3 -4 -4 -2 -2 -2 -1 -3 -3 -3 -2 -2 -4 -2  0 -1 -5 -3 -1 -4 -2 -2 -7
R -3  8 -2 -4 -6  0 -2 -5 -2 -6 -4  1 -3 -5 -4 -2 -3 -5 -3 -5 -3 -1 -2 -7
N -4 -2  8  0 -5 -1 -2 -2  0 -6 -6 -1 -4 -5 -4  0 -1 -7 -4 -5  6 -2 -2 -7
D -4 -4  0  8 -6 -2  0 -3 -3 -5 -6 -2 -6 -6 -3 -1 -3 -7 -6 -6  6  0 -3 -7
C -2 -6 -5 -6 10 -5 -7 -5 -5 -3 -3 -6 -3 -5 -5 -2 -2 -4 -4 -2 -5 -6 -4 -7
Q -2  0 -1 -2 -5  8  1 -4  0 -6 -4  0 -1 -6 -3 -1 -2 -3 -3 -4 -1  6 -2 -7
E -2 -2 -2  0 -7  1  7 -4 -1 -6 -5  0 -4 -6 -3 -1 -2 -5 -4 -4  0  6 -2 -7
G -1 -5 -2 -3 -5 -4 -4  7 -4 -7 -6 -3 -5 -5 -4 -2 -4 -4 -5 -6 -2 -4 -4 -7
H -3 -2  0 -3 -5  0 -1 -4 10 -6 -5 -2 -3 -3 -4 -2 -4 -5  0 -6 -1 -1 -3 -7
I -3 -6 -6 -5 -3 -6 -6 -7 -6  6  0 -5  0 -1 -5 -5 -2 -5 -3  2 -5 -6 -2 -7
L -3 -4 -6 -6 -3 -4 -5 -6 -5  0  6 -5  1 -1 -5 -5 -3 -3 -3  0 -6 -5 -2 -7
K -2  1 -1 -2 -6  0  0 -3 -2 -5 -5  7 -3 -6 -2 -1 -2 -5 -3 -4 -2  0 -2 -7
M -2 -3 -4 -6 -3 -1 -4 -5 -3  0  1 -3  9 -1 -5 -3 -2 -3 -3  0 -5 -2 -1 -7
F -4 -5 -5 -6 -5 -6 -6 -5 -3 -1 -1 -6 -1  8 -6 -4 -4  0  1 -3 -6 -6 -3 -7
P -2 -4 -4 -3 -5 -3 -3 -4 -4 -5 -5 -2 -5 -6  9 -2 -3 -6 -5 -4 -4 -3 -4 -7
S  0 -2  0 -1 -2 -1 -1 -2 -2 -5 -5 -1 -3 -4 -2  7  0 -5 -3 -4 -1 -1 -2 -7
T -1 -3 -1 -3 -2 -2 -2 -4 -4 -2 -3 -2 -2 -4 -3  0  7 -4 -3 -1 -2 -2 -2 -7
W -5 -5 -7 -7 -4 -3 -5 -4 -5 -5 -3 -5 -3  0 -6 -5 -4 12  0 -6 -7 -4 -4 -7
Y -3 -3 -4 -6 -4 -3 -4 -5  0 -3 -3 -3 -3  1 -5 -3 -3  0  9 -3 -5 -3 -2 -7
V -1 -5 -5 -6 -2 -4 -4 -6 -6  2  0 -4  0 -3 -4 -4 -1 -6 -3  6 -6 -4 -2 -7
B -4 -3  6  6 -5 -1  0 -2 -1 -5 -6 -2 -5 -6 -4 -1 -2 -7 -5 -6  7 -1 -3 -7
Z -2 -1 -2  0 -6  6  6 -4 -1 -6 -5  0 -2 -6 -3 -1 -2 -4 -3 -4 -1  7 -2 -7
X -2 -2 -2 -3 -4 -2 -2 -4 -3 -2 -2 -2 -1 -3 -4 -2 -2 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -7
* -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7 -7  1
