HLADB-1.14.0-Apr2001
HLA-Cw*17 Sequence Alignments
Sequences Aligned: 12 Apr 2001
Steven G. E. Marsh, Anthony Nolan Research Institute.

            -30        -20        -10     -1
            |          |          |        |
Cw*0102           MRVM APRTLILLLS GALALTETWA
Cw*1701           ---- --QA-L---- -----I----
Cw*1702           ---- ---------- -----I----
Cw*1703           ---- --QA-L---- -----I---T

            1       10         20         30         40         50         60         70         80         90        100
            |        |          |          |          |          |          |          |          |          |          |
Cw*0102     CSHSMKYFFT SVSRPGRGEP RFISVGYVDD TQFVRFDSDA ASPRGEPRAP WVEQEGPEYW DRETQKYKRQ AQTDRVSLRN LRGYYNQSEA GSHTLQWMCG
Cw*1701     G----R--Y- A--------- ---A------ ---------- ---------- ---------- ---------- --A---N--K ---------- ----I-R-Y-
Cw*1702     G----R--Y- A--------- ---A------ ---------- ---------- ---------- ---------- --A---N--K ---------- ----I-R-Y-
Cw*1703     G----R--Y- A--------- ---A------ ---------- ---------- ---------- ---------- --A---N--K ---------- ----I-R-Y-

                   110        120        130        140        150        160        170        180        190        200
                     |          |          |          |          |          |          |          |          |          |
Cw*0102     CDLGPDGRLL RGYDQYAYDG KDYIALNEDL RSWTAADTAA QITQRKWEAA REAEQRRAYL EGTCVEWLRR YLENGKETLQ RAEHPKTHVT HHPVSDHEAT
Cw*1701     ---------- ---N-F---- ---------- ---------- --S---L--- -----L---- --E------G ---------- ---R------ ----------
Cw*1702     ---------- ---N-F---- ---------- ---------- --S---L--- -----L---- --E------G ---------- ---R------ ----------
Cw*1703     ---------- ---N-F---- ---------- ---------- --S---L--- -----L---- --E------G ---------- ---R------ ----------

                   210        220        230        240        250        260        270        280        290        300
                     |          |          |          |          |          |          |          |          |          |
Cw*0102     LRCWALGFYP AEITLTWQWD GEDQTQDTEL VETRPAGDGT FQKWAAVMVP SGEEQRYTCH VQHEGLPEPL TLRWEPSSQP TIPIVGIVAG LAVLAVLAVL
Cw*1701     ---------- --------R- ---------- ---------- -------V-- --Q------- ------Q--C ----K----- ---NL---S- P---------
Cw*1702     ---------- --------R- ---------- ---------- -------V-- --Q------- ------Q--C ----****** ********** **********
Cw*1703     ---------- --------R- ---------- ---------- -------V-- --Q------- ------Q--C ----K----- ---NL---S- P---------

                   310        320        330        340
                     |          |          |          |
Cw*0102     ...... GAVVAVVMCR RKSSGGKGGS CSQAASSNSA QGSDESLIAC KA
Cw*1701     AVLAVL -----A-IH- ---------- ---------- ---------- --
Cw*1702     ****** ********** ********** ********** ********** **
Cw*1703     AVLAVL -----A-I** ********** ********** ********** **

