HLADB-2.6.0-Jul 2004
HLA-DPA1 Protein Sequence Alignments
Sequences Aligned: 09 Jul 2004
Steven G. E. Marsh, Anthony Nolan Research Institute.


Prot. Pos.                 -30        -20        -10        
                             |          |          |
DPA1*010301                M RPEDRMFHIR AVILRALSLA FLLSLRGAGA 
DPA1*010302                * ********** ********** ********** 
DPA1*0104                  * ********** ********** ********** 
DPA1*0105                  * ********** ********** ********** 
DPA1*0106                  * ********** ********** ********** 
DPA1*0107                  * ********** ********** ********** 
DPA1*0108                  * ********** ********** ********** 
DPA1*020101                * ********** ********** ********** 
DPA1*020102                * ********** ********** ********** 
DPA1*020103                * ********** ********** ********** 
DPA1*020104                * ********** ********** ********** 
DPA1*020105                * ********** ********** ********** 
DPA1*020106                * ********** ********** ********** 
DPA1*020201                * ********** ********** ********** 
DPA1*020202                * ********** ********** ********** 
DPA1*020203                * ********** ********** ********** 
DPA1*0203                  * ********** ********** ********** 
DPA1*0301                  * ********** ********** ********** 
DPA1*0302                  * ********** ********** ********** 
DPA1*0401                  * ********** ********** ********** 

Prot. Pos.                10         20         30         40         50         60         70         80         90        100 
                           |          |          |          |          |          |          |          |          |          |
DPA1*010301       IKADHVSTYA AFVQTHRPTG EFMFEFDEDE MFYVDLDKKE TVWHLEEFGQ AFSFEAQGGL ANIAILNNNL NTLIQRSNHT QATNDPPEVT VFPKEPVELG 
DPA1*010302       ********** ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----****** ********** 
DPA1*0104         *********- ---------- -------D-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 
DPA1*0105         *********- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --A-****** ********** 
DPA1*0106         ***------- ---------- ---------- Q--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----****** ********** 
DPA1*0107         ****------ ---------- ---------- ---------- ---------- T--------- ---------- ---------- ----****** ********** 
DPA1*0108         ***------- ---------- -------D-- ---------- ---------R ---------- ---------- ---------- ----****** ********** 
DPA1*020101       ---------- ---------- ---------- Q--------- ---------R ---------- ---------- ---------- --A------- ---------- 
DPA1*020102       ***------- ---------- ---------- Q--------- ---------R ---------- ---------- ---------- --A-****** ********** 
DPA1*020103       ***------- ---------- ---------- Q--------- ---------R ---------- ---------- ---------- --A-****** ********** 
DPA1*020104       ********** ---------- ---------- Q--------- ---------R ---------- ---------- ---------- --A-****** ********** 
DPA1*020105       ***------- ---------- ---------- Q--------- ---------R ---------- ---------- ---------- --A-****** ********** 
DPA1*020106       ---------- ---------- ---------- Q--------- ---------R ---------- ---------- ---------- --A---**** ********** 
DPA1*020201       *******--- M--------- ---------- Q--------- ---------R ---------- ---------- ---------- --A------- ---------- 
DPA1*020202       ***------- M--------- ---------- Q--------- ---------R ---------- ---------- ---------- --A------- ---------- 
DPA1*020203       *****----- M--------- ---------- Q--------- ---------R ---------- ---------- ---------- --A-****** ********** 
DPA1*0203         ***------- ---------- ---------- ---------- ---------R ---------- ---------- ---------- --A-****** ********** 
DPA1*0301         *********- M--------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----S---- ---------- ---------- ---------- 
DPA1*0302         ***------- M--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----****** ********** 
DPA1*0401         *********- -------T-- -------D-- ---------- ---------R ---------- ---------- -IA------- --A------- -----A---- 

Prot. Pos.               110        120        130        140        150        160        170        180        190        200 
                           |          |          |          |          |          |          |          |          |          |
DPA1*010301       QPNTLICHID KFFPPVLNVT WLCNGELVTE GVAESLFLPR TDYSFHKFHY LTFVPSAEDF YDCRVEHWGL DQPLLKHWEA QEPIQMPETT ETVLCALGLV 
DPA1*010302       ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 
DPA1*0104         ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 
DPA1*0105         ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 
DPA1*0106         ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 
DPA1*0107         ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 
DPA1*0108         ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 
DPA1*020101       ---------- R--------- ------P--- ---------- ---------- ---------V ---------- ---------- ---------- ---------- 
DPA1*020102       ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 
DPA1*020103       ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 
DPA1*020104       ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 
DPA1*020105       ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 
DPA1*020106       ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 
DPA1*020201       ---------- R--------- ------P--- ---------- ---------- ---------V ---------- ---------- ---------- ---------- 
DPA1*020202       ---------- R--------- ------P--- ---------- ---------- ---------V ---------- ---------- ---------- ---------- 
DPA1*020203       ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 
DPA1*0203         ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 
DPA1*0301         ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 
DPA1*0302         ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 
DPA1*0401         ---------- ---------- ------P--- ---------- ---------- ---------V ---------- ---------- ---------A ---------- 

Prot. Pos.               210        220       229        
                           |          |         |
DPA1*010301       LGLVGIIVGT VLIIKSLRSG HDPRAQGTL        
DPA1*010302       ********** ********** *********        
DPA1*0104         ---------- ---------- ---------        
DPA1*0105         ********** ********** *********        
DPA1*0106         ********** ********** *********        
DPA1*0107         ********** ********** *********        
DPA1*0108         ********** ********** *********        
DPA1*020101       ---------- ---------- -------P-        
DPA1*020102       ********** ********** *********        
DPA1*020103       ********** ********** *********        
DPA1*020104       ********** ********** *********        
DPA1*020105       ********** ********** *********        
DPA1*020106       ********** ********** *********        
DPA1*020201       ---------- ---------- -------P-        
DPA1*020202       ---------- ---------- -------P-        
DPA1*020203       ********** ********** *********        
DPA1*0203         ********** ********** *********        
DPA1*0301         ---------- ---------- ---------        
DPA1*0302         ********** ********** *********        
DPA1*0401         ---------- ---------- -------P-
