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LICENSE
MANIFEST.in
README.md
setup.cfg
setup.py
assets/REDIdb_MT.txt
assets/dbSNP_MT.txt
assets/formatted_table_wobble.csv
assets/weng2024_mut_spectrum_ref.csv
src/mito/__init__.py
src/mito/io/__init__.py
src/mito/io/format_afm.py
src/mito/io/phylo_io.py
src/mito/pl/__init__.py
src/mito/pl/diagnostic_plots.py
src/mito/pl/embeddings_plots.py
src/mito/pl/heatmaps_plots.py
src/mito/pl/other_plots.py
src/mito/pl/phylo_plots.py
src/mito/pp/__init__.py
src/mito/pp/dimred.py
src/mito/pp/distances.py
src/mito/pp/filters.py
src/mito/pp/kNN.py
src/mito/pp/preprocessing.py
src/mito/tl/__init__.py
src/mito/tl/_classification.py
src/mito/tl/annotate.py
src/mito/tl/bootstrap.py
src/mito/tl/clustering.py
src/mito/tl/phenotype.py
src/mito/tl/phylo.py
src/mito/ut/__init__.py
src/mito/ut/de_utils.py
src/mito/ut/metrics.py
src/mito/ut/phylo_utils.py
src/mito/ut/positions.py
src/mito/ut/stats_utils.py
src/mito/ut/utils.py
src/mito_utils.egg-info/PKG-INFO
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