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strkit/utils.py
strkit.egg-info/PKG-INFO
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strkit.egg-info/dependency_links.txt
strkit.egg-info/entry_points.txt
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strkit/call/__init__.py
strkit/call/align_matrix.py
strkit/call/allele.py
strkit/call/call_locus.py
strkit/call/call_sample.py
strkit/call/cigar.py
strkit/call/gmm.py
strkit/call/loci.py
strkit/call/non_daemonic_pool.py
strkit/call/params.py
strkit/call/realign.py
strkit/call/repeats.py
strkit/call/snvs.py
strkit/call/types.py
strkit/call/utils.py
strkit/call/output/__init__.py
strkit/call/output/json_report.py
strkit/call/output/tsv.py
strkit/call/output/vcf.py
strkit/catalog/__init__.py
strkit/catalog/combine.py
strkit/convert/__init__.py
strkit/convert/_bed_4.py
strkit/convert/constants.py
strkit/convert/converter.py
strkit/convert/expansionhunter.py
strkit/convert/gangstr.py
strkit/convert/hipstr.py
strkit/convert/trgt.py
strkit/data/ploidy_configs/diploid_autosomes.json
strkit/data/ploidy_configs/diploid_xx.json
strkit/data/ploidy_configs/diploid_xy.json
strkit/data/ploidy_configs/haploid.json
strkit/mi/__init__.py
strkit/mi/base.py
strkit/mi/expansionhunter.py
strkit/mi/gangstr.py
strkit/mi/generic_vcf.py
strkit/mi/intervals.py
strkit/mi/repeathmm.py
strkit/mi/result.py
strkit/mi/straglr.py
strkit/mi/strkit.py
strkit/mi/tandem_genotypes.py
strkit/mi/trgt.py
strkit/mi/vcf_utils.py
strkit/viz/__init__.py
strkit/viz/server.py
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strkit/viz/templates/browser.html
tests/test_caller_loci_fns.py
tests/test_caller_utils.py
tests/test_iupac.py
tests/test_mi_intervals.py
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tests/test_utils.py