u s a g e :   r u n . p y   [ - h ]   [ - p   P A T H ]   [ - o   O P T I O N S ]   [ - b   B I N S ]   [ - v   C H A N N E L ] 
 
                             [ - g   C O N T R O L _ G R O U P ]   [ - H   H E A D E R ]   [ - M ]   [ - m   M P _ N A M E ]   [ - G ]   [ - F ] 
 
                             [ - f   D I S T A N C E _ C H A N N E L S ]   [ - C ]   [ - c   C L U S T E R _ C H A N N E L S ] 
 
                             [ - d   C L U S T E R _ D I S T A N C E ]   [ - B ]   [ - W ]   [ - r ]   [ - D ] 
 
 
 
 P e r f o r m   L A M   a n a l y s i s . 
 
 
 
 o p t i o n a l   a r g u m e n t s : 
 
     - h ,   - - h e l p                         s h o w   t h i s   h e l p   m e s s a g e   a n d   e x i t 
 
     - p   P A T H ,   - - p a t h   P A T H     A n a l y s i s   d i r e c t o r y   p a t h 
 
     - o   O P T I O N S ,   - - o p t i o n s   O P T I O N S 
 
                                                 p r i m a r y   o p t i o n   s t r i n g :   r   ( p r o c e s s ) ,   c   ( c o u n t ) ,   d 
 
                                                 ( d i s t a n c e ) ,   l   ( p l o t s ) ,   s   ( s t a t s ) 
 
     - b   B I N S ,   - - b i n s   B I N S     S a m p l e   b i n   n u m b e r 
 
     - v   C H A N N E L ,   - - c h a n n e l   C H A N N E L 
 
                                                 V e c t o r   c h a n n e l   n a m e 
 
     - g   C O N T R O L _ G R O U P ,   - - c o n t r o l _ g r o u p   C O N T R O L _ G R O U P 
 
                                                 N a m e   o f   c o n t r o l   g r o u p 
 
     - H   H E A D E R ,   - - h e a d e r   H E A D E R 
 
                                                 H e a d e r   r o w   n u m b e r 
 
     - M ,   - - m e a s u r e m e n t _ p o i n t 
 
                                                 t o g g l e   u s e M P 
 
     - m   M P _ N A M E ,   - - m p _ n a m e   M P _ N A M E 
 
                                                 N a m e   o f   M P 
 
     - G ,   - - G U I                           t o g g l e   G U I 
 
     - F ,   - - f e a t u r e _ d i s t a n c e s 
 
                                                 f - t o - f   d i s t a n c e s 
 
     - f   D I S T A N C E _ C H A N N E L S ,   - - D i s t a n c e _ c h a n n e l s   D I S T A N C E _ C H A N N E L S 
 
                                                 f - t o - f   d i s t a n c e   c h a n n e l s 
 
     - C ,   - - c l u s t e r s                 F e a t u r e   c l u s t e r i n g 
 
     - c   C L U S T E R _ C H A N N E L S ,   - - c l u s t e r _ c h a n n e l s   C L U S T E R _ C H A N N E L S 
 
                                                 C l u s t e r i n g   c h a n n e l s 
 
     - d   C L U S T E R _ D I S T A N C E ,   - - c l u s t e r _ d i s t a n c e   C L U S T E R _ D I S T A N C E 
 
                                                 C l u s t e r i n g   m a x   d i s t a n c e 
 
     - B ,   - - b o r d e r s                   T o g g l e   b o r d e r   d e t e c t i o n 
 
     - W ,   - - w i d t h s                     T o g g l e   w i d t h   c a l c u l a t i o n 
 
     - r ,   - - n o _ p r o j e c t i o n       P r o j e c t i o n   t o   f a l s e 
 
     - D ,   - - f o r c e _ d i a l o g         F o r c e   n o   u s e r   i n p u t 
 
 