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RUNX1	RUNX1T1	known,chimerdb2,ticdb,tcga,cell_lines	0	41	2	27	BOWTIE;BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	21:34859474:-	8:92017431:-	ENSG00000159216	ENSG00000079102	ENSE00003512550	ENSE00002107742	AGAGCCATCAAAATCACAGTGGATGGGCCCCGAGAACCTCGAA*ATAAACCCCACTTGAAAAACTGAGGTGCTTAAGGAGTAAAATA	in-frame	ENST00000437180:803/ENST00000519422:370;ENST00000437180:803/ENST00000521897:278;ENST00000437180:803/ENST00000519577:285;ENST00000399237:630/ENST00000519422:370;ENST00000399237:630/ENST00000521897:278;ENST00000399237:630/ENST00000519577:285;ENST00000399240:603/ENST00000519422:370;ENST00000399240:603/ENST00000521897:278;ENST00000399240:603/ENST00000519577:285;ENST00000300305:1058/ENST00000519422:370;ENST00000300305:1058/ENST00000521897:278;ENST00000300305:1058/ENST00000519577:285;ENST00000358356:2110/ENST00000519422:370;ENST00000358356:2110/ENST00000521897:278;ENST00000358356:2110/ENST00000519577:285;ENST00000344691:2110/ENST00000519422:370;ENST00000344691:2110/ENST00000521897:278;ENST00000344691:2110/ENST00000519577:285	MASDSIFESFPSYPQCFMRECILGMNPSRDVHDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRNKPHLKN;MASDSIFESFPSYPQCFMRECILGMNPSRDVHDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRNKPHLKN;MASDSIFESFPSYPQCFMRECILGMNPSRDVHDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRNKPHLKN;MPAAPRGPAQGEAAARTRSRDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRNKPHLKN;MPAAPRGPAQGEAAARTRSRDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRNKPHLKN;MPAAPRGPAQGEAAARTRSRDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRNKPHLKN;MRIPVDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRNKPHLKN;MRIPVDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRNKPHLKN;MRIPVDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRNKPHLKN;MASDSIFESFPSYPQCFMRECILGMNPSRDVHDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRNKPHLKN;MASDSIFESFPSYPQCFMRECILGMNPSRDVHDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRNKPHLKN;MASDSIFESFPSYPQCFMRECILGMNPSRDVHDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRNKPHLKN;MRIPVDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRNKPHLKN;MRIPVDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRNKPHLKN;MRIPVDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRNKPHLKN;MRIPVDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRNKPHLKN;MRIPVDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRNKPHLKN;MRIPVDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRNKPHLKN
SMG5	PAQR6	adjacent,known,healthy,hpa,banned,1K<gap<10K,readthrough	0	14	12	61	BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	1:156249569:-	1:156246756:-	ENSG00000198952	ENSG00000160781			GCCTTCCGCAGGACTGAAGACCTGAAGGGGCTGGCTTTTGGAGTGTTGAG*GTCAACGTGGAGGTACCAGGCCACCATGCTCAGTCTCAAGCTGCCCCAAC	UTR/UTR		
SMG5	PAQR6	adjacent,known,healthy,hpa,banned,1K<gap<10K,readthrough	0	14	1	47	BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	1:156249569:-	1:156246250:-	ENSG00000198952	ENSG00000160781			GCCTTCCGCAGGACTGAAGACCTGAAGGGGCTGGCTTTTGGAGTGTTGAG*GTGTTCTGGGAAGATGGCATCATGTCTGGCTACCGCCGCCCCACCAGCTC	UTR/CDS(truncated)		
DHRS1	RABGGTA	adjacent,known,healthy,bodymap2,hpa,banned,10K<gap<100K,readthrough	0	12	12	55	BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	14:24298614:-	14:24271310:-	ENSG00000157379	ENSG00000100949			TGAGCCATGATCACACCACTGCACTCCAGTCTAGACGACACAGCGAGACA*CTCTTGTGGAACGTGCAAAGCCTGTCCCAGGACCTCTTTACACTCTGGGG	intronic/UTR		
DHRS1	RABGGTA	adjacent,known,healthy,bodymap2,hpa,banned,10K<gap<100K,readthrough	0	12	11	57	BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	14:24292198:-	14:24271310:-	ENSG00000157379	ENSG00000100949			GACAGAACTGCTGAAGGAGCATATGGCAAAGGAGGAGGTCCTGCAGGATC*CTCTTGTGGAACGTGCAAAGCCTGTCCCAGGACCTCTTTACACTCTGGGG	CDS(truncated)/UTR		
DHRS1	RABGGTA	adjacent,known,healthy,bodymap2,hpa,banned,10K<gap<100K,readthrough	0	12	1	52	BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	14:24292039:-	14:24271310:-	ENSG00000157379	ENSG00000100949			CTGTGGCAGGTGCAGGGCTGAGCATGGGACACACATTATTTCCTTTAATC*CTCTTGTGGAACGTGCAAAGCCTGTCCCAGGACCTCTTTACACTCTGGGG	intronic/UTR		
CH17-262H11.1	IGH@		0	8	2	48	BOWTIE+BLAT	14:106025536:-	14:105708664:-	ENSG00000282122	ENSG09000001013			CACCATGGACTGGACCTGGAGGATCCTCTTCTTGGTGGCAGCAGCAACAG*CATCCCCGACCAGCCCCAAGGTCTTCCCGCTGAGCCTCTGCAGCACCCAG	CDS(no-known-start-or-end)/---		
AC004791.2	AC004510.3	no_protein,adjacent,lincrna,10K<gap<100K,readthrough	0	7	5	30	BOWTIE;BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	19:15854733:-	19:15827224:-	ENSG00000267453	ENSG00000267308	ENSE00002773394	ENSE00002785429	GAAGTGCCCACAGGTGGATGGATGGCTCAGCCCCCACCTACAT*AGTGAGAACTTGTGACGGTGAATAACTCTTCTCTTTCCTGGTA	exonic(no-known-CDS)/exonic(no-known-CDS)		
IGH@	MPO		0	7	1	63	BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	14:105708144:+	17:58270614:-	ENSG09000000013	ENSG00000005381			AGATGGGGTAGGTGGAGTTGAGGGAGATGGGGTAGGTGGAGTTGAGGGAA*CTGGCCAGTTGGAACCACGGAGATCTCCTTGCCCTAGATGAGCCCAGCCC	---/UTR		
IGH@	MPO		0	7	1	50	BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	14:105643936:+	17:58270811:-	ENSG09000000013	ENSG00000005381			TCATGAGGGTGTCCTTGGGTTTTGGGGGGAAGAGGAAGACTGACGGTCCT*GCCCAGATCTCATTGCCCCGGATCATCTGCGACAACACAGGCATCACCAC	---/CDS(truncated)		
IGH@	MPO		0	7	1	48	BOWTIE+BLAT	14:105708120:+	17:58270850:-	ENSG09000000013	ENSG00000005381			CAGTCGGGGGTGGCAGCATGAGGGAGATGGGGTAGGTGGAGTTGAGGGAG*AACGAGGGTGTGTTCAGCATGCAGCAGCGACAGGCCCTGGCCCAGATCTC	---/CDS(truncated)		
IGH@	MPO		0	7	1	47	BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	14:105741671:+	17:58271712:-	ENSG09000000013	ENSG00000005381			CCAGCACGGGAGGCGTGGTCTTGTAGTTGTTCTCCGGCTGCCCATTGCTC*GCCCACTCCTCGCCTGCATCATCGGTACCCAGTTCAGGAAGCTCCGGGAT	---/CDS(truncated)		
IGH@	MPO		0	7	1	47	BOWTIE+STAR	14:105624674:+	17:58271712:-	ENSG09000000013	ENSG00000005381			CCAGCACGGGAGGCGTGGTCTTGTAGTTGTTCTCCGGCTGCCCATTGCTC*GCCCACTCCTCGCCTGCATCATCGGTACCCAGTTCAGGAAGCTCCGGGAT	---/CDS(truncated)		
IGH@	MPO		0	7	1	47	BOWTIE+STAR	14:105707505:+	17:58271843:-	ENSG09000000013	ENSG00000005381			CTTGGGGCTGAAGCCGCGTGCCAGGCACGTCAGCGTCACCAGCTCGTTCA*GGGCCAGCTGGGCACGGTGCTGAGGAACCTGAAATTGGCGAGGAAACTGA	---/CDS(truncated)		
QPRT	SPN	adjacent,1K<gap<10K	10	7	5	52	BOWTIE+BLAT	16:29691156:+	16:29669412:+	ENSG00000103485	ENSG00000197471			GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGAGGATCACCTGAGGTCAG*GCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCTGCTGATCCGTATGCCTCGGCCTCCCA	intronic/UTR		
QPRT	SPN	adjacent,1K<gap<10K	10	7	5	22	BOWTIE+STAR	16:29693877:+	16:29668716:+	ENSG00000103485	ENSG00000197471			GATCCTCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCA*GGGATTATAGGTGTGAGCCACTGTGCCCAGGCTTGCCTCAGATATTTGAA	intronic/UTR		
QPRT	SPN	adjacent,1K<gap<10K	10	7	4	46	BOWTIE+BLAT	16:29685257:+	16:29669416:+	ENSG00000103485	ENSG00000197471			CACCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGCAGGTGGATCACCTGAG*GTCTTGAACTCCCGACCTCTGCTGATCCGTATGCCTCGGCCTCCCAAAGT	intronic/UTR		
QPRT	SPN	adjacent,1K<gap<10K	10	7	3	46	BOWTIE+STAR	16:29685256:+	16:29669406:+	ENSG00000103485	ENSG00000197471			ACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGCAGGTGGATCACCTGA*GGTCAAGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCTGCTGATCCGTATGCCTCGGC	intronic/UTR		
SIDT2	TAGLN	adjacent,known,healthy,bodymap2,hpa,banned,1K<gap<10K,readthrough	0	7	5	57	BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	11:117195915:+	11:117203002:+	ENSG00000149577	ENSG00000149591			ACGACATCTGGCACTTCCTCTCCTCCATCGCCATGTTCGGGTCCTTCCTG*CTTTCCCCAGACATGGCCAACAAGGGTCCTTCCTATGGCATGAGCCGCGA	CDS(truncated)/UTR		
SPN	QPRT	adjacent,1K<gap<10K,readthrough	10	7	13	30	BOWTIE+STAR	16:29668735:+	16:29686774:+	ENSG00000197471	ENSG00000103485			GGTCCTCCCACCTAAGCTTCCCCAAATACTGGGATTATAGGTGTGAGCCA*GGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCTCCAACTCCTGGCCTTGT	UTR/intronic		
SPN	QPRT	adjacent,1K<gap<10K,readthrough	10	7	7	62	BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	16:29670782:+	16:29679120:+	ENSG00000197471	ENSG00000103485			GGGAAACAAAGGACCCATCGCAAATGTTTTCCATGCTGATCTCCAAAGTG*TCCCACCCCCAGCCTGGGGCCTCTGGGAGCCTTGGTCCTGAGCAGCCAAC	UTR/UTR		
SPN	QPRT	adjacent,1K<gap<10K,readthrough	10	7	3	41	BOWTIE+STAR	16:29669722:+	16:29691211:+	ENSG00000197471	ENSG00000103485			AGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTTTCAAAATACAA*AAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGG	UTR/intronic		
SPN	QPRT	adjacent,1K<gap<10K,readthrough	10	7	1	56	BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	16:29663316:+	16:29679120:+	ENSG00000197471	ENSG00000103485			AGGTGGTGGAGTGACCTGGCCCCAGTGCTGCGTCCTTATCAGCCGAGCCG*TCCCACCCCCAGCCTGGGGCCTCTGGGAGCCTTGGTCCTGAGCAGCCAAC	UTR/UTR		
CACNB1	ARL5C	adjacent,1K<gap<10K,readthrough	0	5	4	51	BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	17:39177204:-	17:39166775:-	ENSG00000067191	ENSG00000141748			GCCATGTAGTGGGCGCCCTGCCCGTCTTCCCTCCTGCTCTGGGGTCGGAA*CTTAGTGGAGGCTGCAGGAAGGCAGTACAGTCGGGTGGAAGGAGCTGGCT	UTR/UTR		
CD74	MPO		0	5	1	63	BOWTIE+STAR	5:150401756:-	17:58273564:-	ENSG00000019582	ENSG00000005381			CAGGCTGAGCCACTCTCTTCCCTTTCCCCAGCATCACTCCCCAAGGAAGA*GCCAACGTCTTCACCAATGCCTTCCGCTACGGCCACACCCTCATCCAACC	UTR/CDS(truncated)		
CD74	MPO		0	5	1	61	BOWTIE+BLAT	5:150401754:-	17:58273562:-	ENSG00000019582	ENSG00000005381			GGCTGAGCCACTCTCTTCCCTTTCCCCAGCATCACTCCCCAAGGAAGAGC*CAACGTCTTCACCAATGCCTTCCGCTACGGCCACACCCTCATCCAACCCT	UTR/CDS(truncated)		
CH17-262H11.1	IGHA1		0	5	2	48	BOWTIE+BLAT	14:106025536:-	14:105708664:-	ENSG00000282122	ENSG00000211895			CACCATGGACTGGACCTGGAGGATCCTCTTCTTGGTGGCAGCAGCAACAG*CATCCCCGACCAGCCCCAAGGTCTTCCCGCTGAGCCTCTGCAGCACCCAG	CDS(no-known-start-or-end)/CDS(truncated)		
CTBS	GNG5	adjacent,known,healthy,bodymap2,hpa,banned,10K<gap<100K,readthrough	0	5	3	59	BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	1:84563257:-	1:84501970:-	ENSG00000117151	ENSG00000174021			CTGGAAACCTATGGGATAAAGATCAGCGGGCTCCTTATTATAACTATAAA*GTTTCCCAGGCAGCTGCAGACTTGAAACAGTTCTGTCTGCAGAATGCTCA	in-frame	ENST00000370630:1006/ENST00000370645:422;ENST00000370630:1006/ENST00000370641:556	MSRPQLRRWRLVSSPPSGVPGLALLALLALLALRLAAGTDCPCPEPELCRPIRHHPDFEVFVFDVGQKTWKSYDWSQITTVATFGKYDSELMCYAHSKGARVVLKGDVSLKDIIDPAFRASWIAQKLNLAKTQYMDGINIDIEQEVNCLSPEYDALTALVKETTDSFHREIEGSQVTFDVAWSPKNIDRRCYNYTGIADACDFLFVMSYDEQSQIWSECIAAANAPYNQTLTGYNDYIKMSINPKKLVMGVPWYGYDYTCLNLSEDHVCTIAKVPFRGAPCSDAAGRQVPYKTIMKQINSSISGNLWDKDQRAPYYNYKVSQAAADLKQFCLQNAQHDPLLTGVSSSTNPFRPQKVCSFL;MSRPQLRRWRLVSSPPSGVPGLALLALLALLALRLAAGTDCPCPEPELCRPIRHHPDFEVFVFDVGQKTWKSYDWSQITTVATFGKYDSELMCYAHSKGARVVLKGDVSLKDIIDPAFRASWIAQKLNLAKTQYMDGINIDIEQEVNCLSPEYDALTALVKETTDSFHREIEGSQVTFDVAWSPKNIDRRCYNYTGIADACDFLFVMSYDEQSQIWSECIAAANAPYNQTLTGYNDYIKMSINPKKLVMGVPWYGYDYTCLNLSEDHVCTIAKVPFRGAPCSDAAGRQVPYKTIMKQINSSISGNLWDKDQRAPYYNYKVSQAAADLKQFCLQNAQHDPLLTGVSSSTNPFRPQKVCSFL
MLLT6	MPO		0	4	1	56	BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	17:38726352:+	17:58270441:-	ENSG00000275023	ENSG00000005381			GACTTAGGAGTGCCGAGGGTGGGGAGATGGAGCTGCCCGTCTCAGTGTGT*GTTATGTGTATGTGCCATTTATGTGAGTGTGTGTTTGTGCTGATGAGAAT	UTR/UTR		
MLLT6	MPO		0	4	1	50	BOWTIE+STAR	17:38726399:+	17:58270383:-	ENSG00000275023	ENSG00000005381			TGTGAGTGTGTGTGTGCGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG*TGTGGAAGGCAGCAGAGCGGACTGGTGAGGAGCACAGCTCAGGAACTAGA	UTR/UTR		
MLLT6	MPO		0	4	1	49	BOWTIE+BLAT	17:38726400:+	17:58270382:-	ENSG00000275023	ENSG00000005381			GTGAGTGTGTGTGTGCGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT*GTGGAAGGCAGCAGAGCGGACTGGTGAGGAGCACAGCTCAGGAACTAGAC	UTR/UTR		
MPO	MLLT6		0	4	1	48	BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	17:58270480:-	17:38726388:+	ENSG00000005381	ENSG00000275023			CGTTCATTTGTGTGCTCATGTATGTGCGAAGTATATAAATTGGCTTTTCA*TGTGTGTGTGTGTGTCTGTCTGCCTGTCTCTCTCCTCCTGGACCCAGGGC	UTR/UTR		
AK3	CDC37L1-AS1	no_protein,adjacent,lincrna,10K<gap<100K,readthrough	0	3	3	62	BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	9:4710785:-	9:4679165:-	ENSG00000147853	ENSG00000273061			GGGCTCACGCAATTCTTCTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGAAACTACAG*GCAACAACAGAATTCTGCGAAACTTGGTTGGTTGGAGGAGCACACCAAAA	UTR/exonic(no-known-CDS)		
AK3	CDC37L1-AS1	no_protein,adjacent,lincrna,10K<gap<100K,readthrough	0	3	1	62	BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	9:4712968:-	9:4676749:-	ENSG00000147853	ENSG00000273061			AAAGTTCCACAAAGAAGCCAGAAAGCTTCAGTTACTCCATGAGGAGAAAT*GCTTCTTACATCATGGTTGCAGGATGGCTGCTACAGCTCTGGACATCACA	UTR/exonic(no-known-CDS)		
CSK	MPO		0	3	2	31	BOWTIE+BLAT	15:74786045:+	17:58270394:-	ENSG00000103653	ENSG00000005381			CTCTCTCTTTTTTTTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAG*AATACTGAGTATGTGGAAGGCAGCAGAGCGGACTGGTGAGGAGCACAGCT	intronic/UTR		
CSK	MPO		0	3	2	27	BOWTIE+STAR	15:74786041:+	17:58270398:-	ENSG00000103653	ENSG00000005381			CTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG*TGAGAATACTGAGTATGTGGAAGGCAGCAGAGCGGACTGGTGAGGAGCAC	intronic/UTR		
EAF2	SLC15A2	adjacent,1K<gap<10K,readthrough	0	3	2	49	BOWTIE+BLAT	3:121872788:+	3:121897388:+	ENSG00000145088	ENSG00000163406			CAGTCATAATAGATTTCGAGACAACAGTGGCCTTCTGATGAATACTTTAA*CTGTGCTGATCCTGTATTTCCTGTATTTCCTGCACTGGAATGAAGATACC	in-frame	ENST00000273668:807/ENST00000295605:231;ENST00000273668:807/ENST00000489711:582;ENST00000273668:807/ENST00000469013:123;ENST00000451944:785/ENST00000295605:231;ENST00000451944:785/ENST00000489711:582;ENST00000451944:785/ENST00000469013:123	MNSAAGFSHLDRRERVLKLGESFEKQPRCAFHTVRYDFKPASIDTSSEGYLEVGEGEQVTITLPNIEGSTPPVTVFKGSKKPYLKECILIINHDTGECRLEKLSSNITVKKTRVEGSSKIQYRKEQQQQQMWNSARTPNLVKHSPSEDKMSPASPIDDIERELKAEASLMDQMSSCDSSSDSKSSSSSSSEDSSSDSEDEDCKSSTSDTGNCVSGHPTMTQYRIPDIDASHNRFRDNSGLLMNTLTVLILYFLYFLHWNEDTSTSIYHAFSSLCYFTPILGAAIADSWLGKFKVLSLIGLSLIALGTGGIKPCVAAFGGDQFEEKHAEERTRYFSVFYLSINAGSLISTFITPMLRGDVQCFGEDCYALAFGVPGLLMVIALVVFAMGSKIYNKPPPEGNIVAQVFKCIWFAISNRFKNRSGDIPKRQHWLDWAAEKYPKQLIMDVKALTRVLFLYIPLPMFWALLDQQGSRWTLQAIRMNRNLGFFVLQPDQMQVLNPLLVLIFIPLFDFVIYRLVSKCGINFSSLRKMAVGMILACLAFAVAAAVEIKINEMAPAQPGPQEVFLQVLNLADDEVKVTVVGNENNSLLIESIKSFQKTPHYSKLHLKTKSQDFHFHLKYHNLSLYTEHSVQEKNWYSLVIREDGNSISSMMVKDTESRTTNGMTTVRFVNTLHKDVNISLSTDTSLNVGEDYGVSAYRTVQRGEYPAVHCRTEDKNFSLNLGLLDFGAAYLFVITNNTNQGLQAWKIEDIPANKMSIAWQLPQYALVTAGEVMFSVTGLEFSYSQAPSSMKSVLQAAWLLTIAVGNIIVLVVAQFSGLVQWAEFILFSCLLLVICLIFSIMGYYYVPVKTEDMRGPADKHIPHIQGNMIKLETKKTKL;MNSAAGFSHLDRRERVLKLGESFEKQPRCAFHTVRYDFKPASIDTSSEGYLEVGEGEQVTITLPNIEGSTPPVTVFKGSKKPYLKECILIINHDTGECRLEKLSSNITVKKTRVEGSSKIQYRKEQQQQQMWNSARTPNLVKHSPSEDKMSPASPIDDIERELKAEASLMDQMSSCDSSSDSKSSSSSSSEDSSSDSEDEDCKSSTSDTGNCVSGHPTMTQYRIPDIDASHNRFRDNSGLLMNTLTVLILYFLYFLHWNEDTSTSIYHAFSSLCYFTPILGAAIADSWLGKFKTIIYLSLVYVLGHVIKSLGALPILGGQVVHTVLSLIGLSLIALGTGGIKPCVAAFGGDQFEEKHAEERTRYFSVFYLSINAGSLISTFITPMLRGDVQCFGEDCYALAFGVPGLLMVIALVVFAMGSKIYNKPPPEGNIVAQVFKCIWFAISNRFKNRSGDIPKRQHWLDWAAEKYPKQLIMDVKALTRVLFLYIPLPMFWALLDQQGSRWTLQAIRMNRNLGFFVLQPDQMQVLNPLLVLIFIPLFDFVIYRLVSKCGINFSSLRKMAVGMILACLAFAVAAAVEIKINEMAPAQPGPQEVFLQVLNLADDEVKVTVVGNENNSLLIESIKSFQKTPHYSKLHLKTKSQDFHFHLKYHNLSLYTEHSVQEKNWYSLVIREDGNSISSMMVKDTESRTTNGMTTVRFVNTLHKDVNISLSTDTSLNVGEDYGVSAYRTVQRGEYPAVHCRTEDKNFSLNLGLLDFGAAYLFVITNNTNQGLQAWKIEDIPANKMSIAWQLPQYALVTAGEVMFSVTGLEFSYSQAPSSMKSVLQAAWLLTIAVGNIIVLVVAQFSGLVQWAEFILFSCLLLVICLIFSIMGYYYVPVKTEDMRGPADKHIPHIQGNMIKLETKKTKL;MNSAAGFSHLDRRERVLKLGESFEKQPRCAFHTVRYDFKPASIDTSSEGYLEVGEGEQVTITLPNIEGSTPPVTVFKGSKKPYLKECILIINHDTGECRLEKLSSNITVKKTRVEGSSKIQYRKEQQQQQMWNSARTPNLVKHSPSEDKMSPASPIDDIERELKAEASLMDQMSSCDSSSDSKSSSSSSSEDSSSDSEDEDCKSSTSDTGNCVSGHPTMTQYRIPDIDASHNRFRDNSGLLMNTLTVLILYFLYFLHWNEDTSTSIYHAFSSLCYFTPILGAAIADSWLGKFKTIIYLSLVYVLGHVIKSLGALPILGGQVVHTVLSLIGLSLIALGTGGIKPCVAAFGGDQFEEKHAEERTRYFSVFYLSINAGSLISTFITPMLRGDVQCFGE;MNSAAGFSHLDRRERVLKLGESFEKQPRCAFHTVRYDFKPASIDTSSEGYLEVGEGEQVTITLPNIEGSTPPVTVFKGSKKPYLKECILIINHDTGECRLEKLSSNITVKKTRVEGSSKIQYRKEQQQQQMWNSARTPNLVKHSPSEDKMSPASPIDDIERELKAEASLMDQMSSCDSSSDSKSSSSSSSEDSSSDSEDEDCKSSTSDTGNCVSGHPTMTQYRIPDIDASHNRFRDNSGLLMNTLTVLILYFLYFLHWNEDTSTSIYHAFSSLCYFTPILGAAIADSWLGKFKVLSLIGLSLIALGTGGIKPCVAAFGGDQFEEKHAEERTRYFSVFYLSINAGSLISTFITPMLRGDVQCFGEDCYALAFGVPGLLMVIALVVFAMGSKIYNKPPPEGNIVAQVFKCIWFAISNRFKNRSGDIPKRQHWLDWAAEKYPKQLIMDVKALTRVLFLYIPLPMFWALLDQQGSRWTLQAIRMNRNLGFFVLQPDQMQVLNPLLVLIFIPLFDFVIYRLVSKCGINFSSLRKMAVGMILACLAFAVAAAVEIKINEMAPAQPGPQEVFLQVLNLADDEVKVTVVGNENNSLLIESIKSFQKTPHYSKLHLKTKSQDFHFHLKYHNLSLYTEHSVQEKNWYSLVIREDGNSISSMMVKDTESRTTNGMTTVRFVNTLHKDVNISLSTDTSLNVGEDYGVSAYRTVQRGEYPAVHCRTEDKNFSLNLGLLDFGAAYLFVITNNTNQGLQAWKIEDIPANKMSIAWQLPQYALVTAGEVMFSVTGLEFSYSQAPSSMKSVLQAAWLLTIAVGNIIVLVVAQFSGLVQWAEFILFSCLLLVICLIFSIMGYYYVPVKTEDMRGPADKHIPHIQGNMIKLETKKTKL;MNSAAGFSHLDRRERVLKLGESFEKQPRCAFHTVRYDFKPASIDTSSEGYLEVGEGEQVTITLPNIEGSTPPVTVFKGSKKPYLKECILIINHDTGECRLEKLSSNITVKKTRVEGSSKIQYRKEQQQQQMWNSARTPNLVKHSPSEDKMSPASPIDDIERELKAEASLMDQMSSCDSSSDSKSSSSSSSEDSSSDSEDEDCKSSTSDTGNCVSGHPTMTQYRIPDIDASHNRFRDNSGLLMNTLTVLILYFLYFLHWNEDTSTSIYHAFSSLCYFTPILGAAIADSWLGKFKTIIYLSLVYVLGHVIKSLGALPILGGQVVHTVLSLIGLSLIALGTGGIKPCVAAFGGDQFEEKHAEERTRYFSVFYLSINAGSLISTFITPMLRGDVQCFGEDCYALAFGVPGLLMVIALVVFAMGSKIYNKPPPEGNIVAQVFKCIWFAISNRFKNRSGDIPKRQHWLDWAAEKYPKQLIMDVKALTRVLFLYIPLPMFWALLDQQGSRWTLQAIRMNRNLGFFVLQPDQMQVLNPLLVLIFIPLFDFVIYRLVSKCGINFSSLRKMAVGMILACLAFAVAAAVEIKINEMAPAQPGPQEVFLQVLNLADDEVKVTVVGNENNSLLIESIKSFQKTPHYSKLHLKTKSQDFHFHLKYHNLSLYTEHSVQEKNWYSLVIREDGNSISSMMVKDTESRTTNGMTTVRFVNTLHKDVNISLSTDTSLNVGEDYGVSAYRTVQRGEYPAVHCRTEDKNFSLNLGLLDFGAAYLFVITNNTNQGLQAWKIEDIPANKMSIAWQLPQYALVTAGEVMFSVTGLEFSYSQAPSSMKSVLQAAWLLTIAVGNIIVLVVAQFSGLVQWAEFILFSCLLLVICLIFSIMGYYYVPVKTEDMRGPADKHIPHIQGNMIKLETKKTKL;MNSAAGFSHLDRRERVLKLGESFEKQPRCAFHTVRYDFKPASIDTSSEGYLEVGEGEQVTITLPNIEGSTPPVTVFKGSKKPYLKECILIINHDTGECRLEKLSSNITVKKTRVEGSSKIQYRKEQQQQQMWNSARTPNLVKHSPSEDKMSPASPIDDIERELKAEASLMDQMSSCDSSSDSKSSSSSSSEDSSSDSEDEDCKSSTSDTGNCVSGHPTMTQYRIPDIDASHNRFRDNSGLLMNTLTVLILYFLYFLHWNEDTSTSIYHAFSSLCYFTPILGAAIADSWLGKFKTIIYLSLVYVLGHVIKSLGALPILGGQVVHTVLSLIGLSLIALGTGGIKPCVAAFGGDQFEEKHAEERTRYFSVFYLSINAGSLISTFITPMLRGDVQCFGE
IGH@	MPO		0	3	1	61	BOWTIE+BLAT	14:105741682:-	17:58270220:-	ENSG09000001013	ENSG00000005381			GGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCG*GGAGGGCCCACTTGTATCCTCTGGTTCTTCATTTATTGAGCACCTACTAC	---/UTR		
IGH@	MPO		0	3	1	51	BOWTIE+BLAT	14:105668432:-	17:58271854:-	ENSG09000001013	ENSG00000005381			AAGGCTTCTACCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAG*CCTGAAACTGTGGGCCAGCTGGGCACGGTGCTGAGGAACCTGAAATTGGC	---/CDS(truncated)		
IGH@	MPO		0	3	1	51	BOWTIE+STAR	14:105624666:-	17:58271858:-	ENSG09000001013	ENSG00000005381			GTCAAAGGCTTCTACCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGG*GCAGCCTGAAACTGTGGGCCAGCTGGGCACGGTGCTGAGGAACCTGAAAT	---/CDS(truncated)		
IGH@	MPO		0	3	1	51	BOWTIE+STAR	14:105668436:-	17:58271858:-	ENSG09000001013	ENSG00000005381			GTCAAAGGCTTCTACCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGG*GCAGCCTGAAACTGTGGGCCAGCTGGGCACGGTGCTGAGGAACCTGAAAT	---/CDS(truncated)		
MPO	IGH@		0	3	3	17	BOWTIE+STAR	17:58280606:-	14:105682305:-	ENSG00000005381	ENSG09000001013			GGCTCCTGGCCATTCTGGCCACGCCCCAGCCCTCTGAAGGTGCTGCTCCA*GCTTTCCTGGGGGAGGGCGGTGCGGTGTTGTGTGGGACAGTGAGAGAGGG	CDS(truncated)/---		
MPO	IGH@		0	3	3	17	BOWTIE+STAR	17:58280606:-	14:105561886:-	ENSG00000005381	ENSG09000001013			GGCTCCTGGCCATTCTGGCCACGCCCCAGCCCTCTGAAGGTGCTGCTCCA*GCTTTCCTGGGGGAGGGCGGTGCGGTGTTGTGTGGGACAGTGAGAGAGGG	CDS(truncated)/---		
MPO	ITM2C		0	3	1	47	BOWTIE+BLAT	17:58275656:-	2:230878133:+	ENSG00000005381	ENSG00000135916			AAGGGGACACCCGTTCCAGTGAGATGCCCGAGCTCACCTCCATGCACACC*CTCTTTTCTTCTTTCCGGCTGCTCTCTGGCCCTCCTCCTTCCCCCTGCTT	CDS(truncated)/UTR		
MPO	TPT1		0	3	1	62	BOWTIE+STAR	17:58270719:-	13:45337302:-	ENSG00000005381	ENSG00000133112			TCACCACCGTGTCTAAGAACAACATCTTCATGTCCAACTCATATCCCCGG*CAAATGGGACTGATGTCATCTTGAGCTCTTCATTTATTTTGACTGTGATT	CDS(truncated)/UTR		
MYH9	MPO		0	3	2	42	BOWTIE+STAR	22:36354960:-	17:58270406:-	ENSG00000100345	ENSG00000005381			CTTTCCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG*TGTGCTGATGAGAATACTGAGTATGTGGAAGGCAGCAGAGCGGACTGGTG	intronic/UTR		
MYH9	MPO		0	3	2	42	BOWTIE+STAR	22:36354958:-	17:58270406:-	ENSG00000100345	ENSG00000005381			TTCCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG*TGTGCTGATGAGAATACTGAGTATGTGGAAGGCAGCAGAGCGGACTGGTG	intronic/UTR		
MYH9	MPO		0	3	2	20	BOWTIE+STAR	22:36354958:-	17:58270439:-	ENSG00000100345	ENSG00000005381			TTCCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG*TATGTGTATGTGCCATTTATGTGAGTGTGTGTTTGTGCTGATGAGAATAC	intronic/UTR		
NCOR2	UBC	known,healthy,tcga,gtex	0	3	2	41	BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	12:124567308:-	12:124913774:-	ENSG00000196498	ENSG00000150991			CGGCCCGAGCGCGCCCCAAGCCCGGGCGCCACCGCTGCCACCTCCGCGAG*ACAATGCAGATCTTCGTGAAGACTCTGACTGGTAAGACCATCACCCTCGA	UTR/UTR		
NCOR2	UBC	known,healthy,tcga,gtex	0	3	1	62	BOWTIE+BLAT;BOWTIE+STAR	12:124466173:-	12:124913774:-	ENSG00000196498	ENSG00000150991			TCGAGTCGAAGCACCGCAGCCTGGTGCAGATCATCTACGACGAGAACCGG*ACAATGCAGATCTTCGTGAAGACTCTGACTGGTAAGACCATCACCCTCGA	CDS(truncated)/UTR		
RBM3	TBC1D25	adjacent,10K<gap<100K	0	3	2	29	BOWTIE+STAR	X:48578020:+	X:48554086:+	ENSG00000102317	ENSG00000068354			CTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTG*CAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATC	UTR/intronic		
TBC1D25	RBM3	adjacent,10K<gap<100K,readthrough	0	3	2	17	BOWTIE+STAR	X:48554560:+	X:48578079:+	ENSG00000068354	ENSG00000102317			GATCATACCATTGTGCTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCATCTCA*AAAAAAAAAGGAAATGTGTATCAAGAACATGATTATCCAGCGGTATTTTC	intronic/UTR		
TBC1D25	RBM3	adjacent,10K<gap<100K,readthrough	0	3	2	17	BOWTIE+STAR	X:48557809:+	X:48578079:+	ENSG00000068354	ENSG00000102317			GATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCATCTCA*AAAAAAAAAGGAAATGTGTATCAAGAACATGATTATCCAGCGGTATTTTC	intronic/UTR		
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